棚室西红柿一般采用单秆整枝，只留一个主秆，所有侧枝全部疏除。打侧枝要选晴天上午进行，这样利于伤口愈合。当第一穗果绿熟(果实长到最大，果顶由绿变白)时，除去第一穗果下的老叶，第二穗果绿熟时，除去第二穗果下的老叶，以此类推，这样利于通风透光，减少养分无效消耗，防止病害蔓延。秋延后栽培的当主秆第五穗果开花后，在果穗上方留2~3片叶摘心。越冬茬栽培的等主秆结到6~7穗果后，在果穗上方留2~3片叶摘心，并在秆上开始预留侧枝。当主秆上果实采收完后，如果每一株西红柿都产生了侧枝，则在基部选留一个健壮侧枝，把它上面的老枝剪去。如果某一株没有产生侧枝，则把这一株西红柿放倒，在它旁边的植株上选留两个侧枝，一个侧枝用该植株的吊绳吊起生长，另一侧枝用无侧枝的植株的吊绳吊起生长。第二茬又可结5~6层果实。